Este repositorio reúne todo el código usado para el proyecto. También, el modelo de metadatos que usamos para nuestros conjuntos de datos, referencias a términos de DarwinCore y más.
Código
Nuestro trabajo tiene un fuerte componente de trabajo en R, que hacemos disponible con licencias abiertas a través de GitHub. Encontrá código para limpiar, procesar y controlar la calidad de los datos sobre biodiversidad:
Vertebrados tetrápodos
- Check species names (DwC term:
scientificName
). - Get taxonomic information for a species (DwC terms:
kingdom
,phylum
,class
,order
,familiy
). - Get scientific name authorship for a species (DwC term:
scientificNameAuthorship
). - Get conservation status and population trend (IUCN).
Plantas vasculares
- Check species names and get taxonomic information for a species (DwC term:
scientificName
,genus
,specificEpithet
,infraspecificEpithet
,scientificNameAuthorship
,taxonRank
,taxonID
). - Get higher rank taxonomic information for a species (DwC terms:
kingdom
,phylum
,class
,order
). - Get the state or province of the geographic location of a record (DwC term:
stateProvince
). - Update de event date of a record (DwC term:
eventDate
).
Modelo de metadatos
Para completar los metadatos del conjunto de datos hemos generado el siguiente documento de texto con sugerencias y campos pre-llenados:
Referencias a términos del estándar DarwinCore
Recomendaciones para el uso del estándar DarwinCore en nuestro proyecto: